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上海嘉因单细胞RNA-seq客户文章 | Cell Rep. Med IF=14.3 | 识别垂体瘤分子分类和复发分化标志物

上海嘉因生物scRNA-seq客户文章在Cell Reports Medicine（影响因子14.3）杂志上发表啦！文中单细胞RNA-seq实验由嘉因生物完成。2023年2月，复旦大学附属华山医院赵曜教授团队和中国科学院动物所郭帆研究员团队在Cell Reports Medicine杂志上发表学术论文“Single-cell sequencing identifies differentia...

Br J Cancer IF=8.8 | 上海嘉因CUT&Tag、ATAC-seq和ChIP-seq客户文章 | 染色质可及性与PDAC

2023年6月，山东大学第二医院王传新、山东大学齐鲁医院徐硕/展翰翔团队在British Journal of Cancer杂志上发表学术论文“Chromatin accessibility uncovers KRAS-driven FOSL2 promoting pancreatic ductal adenocarcinoma progression through up-regulati...

Cell Reports IF=8.8 | 上海嘉因生物ATAC-seq客户文章 | CTCF与先锋转录因子形成调控中枢决定细胞命运

2023年10月，中国医学科学院基础医学研究所张勇教授、北京大学生命学院李程教授和广州生物岛实验室朱大海教授团队在Cell Reports杂志上发表学术论文“CTCF coordinates cell fate specification via orchestrating regulatory hubs with pioneer transcription factors”，阐明了CTCF...

Research IF=11 | 上海嘉因CUT&Tag客户文章 | PDAC营养缺乏微环境通过FAM60A-PPAR轴促铁死亡抵抗

2024年2月，上海交通大学、上海市肿瘤研究所聂惠贞团队等在Research杂志上发表学术论文“A Nutrient-Deficient Microenvironment Facilitates Ferroptosis Resistance via the FAM60A–PPAR Axis in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma”，阐明对胰腺导管腺癌（panc...

Cell & Bioscience IF=9.6| 上海嘉因客户文章 | METTL3介导m6A甲基化通过免疫反应调节卵巢癌进展

2023年11月，南方科技大学/暨南大学深圳市人民医院陈善泽团队在Cell & Bioscience杂志上发表学术论文“METTL3-mediated m6A methylation regulates ovarian cancer progression by recruiting myeloid-derived suppressor cells”，为METTL3介导的m6A甲基化提供了新...

Advanced Science 影响因子15.1 | 嘉因生物客户文章 | ac4C修饰促进宫颈癌恶性进程与免疫抑制

2023年10月，南方医科大学郭霞/张健/李欣团队在Advanced Science杂志上发表学术论文“NAT10/ac4C/FOXP1 Promotes Malignant Progression and Facilitates Immunosuppression by Reprogramming Glycolytic Metabolism in Cervical Cancer”，阐明了N...

我有靶基因，再也不愁找上游转录因子了！（下篇）——knockTF2.0数据库应用指南

承接上篇，我们将接着介绍通过使用KnockTF 2.0数据库，从靶基因寻找上游转录因子/转录辅助因子的详细步骤！进入KnockTF 2.0数据库进入KnockTF 2.0数据库主页（http://www.licpathway.net/KnockTF/index.html）。主页对大家的到来表示欢迎，并对KnockTF 2.0数据库进行了简介，该数据库是T(co)F，即转录因子与转录辅助因子敲...

我有靶基因，想找调控它的上游转录因子！（上篇）——KnockTF 2.0转录因子敲除Differential RNAseq数据库

KnockTF 2.0的前世今生2019年末，李春权教授团队在Nucleic Acids Research杂志发表学术论文“KnockTF：a comprehensive human gene expression profile database with knockdown/knockout of transcription factors”，KnockTF 1.0数据库首次呈现。Kno...

Rloop追星，上海嘉因R-loop CUT&Tag 2.0强势来袭

上海嘉因于年初推出Rloop CUT&Tag服务R-loop是真核生物内广泛存在的三链核酸结构。近年来，R-loop被证明是基因表达和基因组稳定性的调节因子，引起了越来越多的关注。R-loop的全基因组定位可以帮助科学家们对Rloop的发生和功能进行精确研究。2024年2月嘉因生物推出Rloop CUT&Tag服务， 该服务基于CUT&Tag体系，利用S9.6抗体，在全基因组水平对R-loo...

R-loop CUT&Tag系列文章之六：R-loop与基因组稳定性

      接着前五篇有关R-loop CUT&Tag的系列文章，包括R-loop概览、R-loop与表观遗传、R-loop与转录终止、R-loop CUT&Tag 系列文章之四-R-loop CUT&Tag技术原理和技术对比和R-loop CUT&Tag系列文章之五：上海嘉因实操R-loop CUT&Tag数据大解密，本篇文章将介绍R-loop与基因组稳定性的关联性。01R-loop与D...

R-loop CUT&Tag系列文章之五：上海嘉因实操R-loop CUT&Tag数据大解密

01嘉因生物R-loop CUT&Tag介绍为了得到高质量的R-loop数据，嘉因生物基于公司已有的CUT&Tag体系，利用S9.6抗体，开发了针对R-loop的CUT&Tag流程，具体流程包括：磁珠结合细胞/细胞核、S9.6 抗体识别R-loop、IgG二抗孵育、PA-Tn5孵育、DNA回收与建库。R-loop CUT&Tag能够在动物细胞或者动物组织上得到R-loop文库，测序后的数据通...

R-loop CUT&Tag 系列文章之四-R-loop CUT&Tag技术原理和技术对比

01全基因组水平R-loop定位方法R-loop是特殊的三链核酸结构，包括DNA：RNA杂合链和一条游离的DNA单链，广泛存在于各种生物的基因组中，包括细菌、酵母、植物和人类等（R-loop CUT&Tag系列文章之一：R-loop概览——结构、形成、分布、调控因子及病理生理功能）。在生物体内，调控因子精准调控R-loop的产生，在基因调控和基因组稳定上发挥重要作用（R-loop CUT&T...